Τα Εργαστηριακά Κέντρα (Ε.Κ.) υπάγονται στο Υ.ΠΑΙ.Θ και αποτελούν ξεχωριστές σχολικές μονάδες με δική τους Διοίκηση και δικό τους εκπαιδευτικό προσωπικό. Τα Εργαστηριακά Κέντρα (Ε.Κ.) ως εκπαιδευτικές μονάδες του Υ.ΠΑΙ.Θ, έχουν αυτοτελή διοικητική δομή στην λειτουργία τους ως σχολικές μονάδες και συνεργάζονται με τα ΕΠΑ.Λ, τα Ι.Ε.Κ. και τα υπόλοιπα σχολεία της περιοχής τους, παρέχοντας την υλικοτεχνική υποδομή τους για την πραγματοποίηση της πρακτικής και των εργαστηριακών ασκήσεων.

Στελέχη Διοίκησης εργαστηριακών κέντρων είναι: α) ο Διευθυντής του Ε.Κ., β) ο Υποδιευθυντής του Ε.Κ. γ) οι υπεύθυνοι τομέων Ε.Κ. και δ) οι υπεύθυνοι εργαστηρίων κατεύθυνσης Ε.Κ. Σε κάθε Ε.Κ. λειτουργεί σύλλογος διδασκόντων, σύμφωνα με το σχετικό ΦΕΚ τΒ’/1318/2015.

Το Εργαστηριακό Κέντρο Σάμου εξυπηρετεί με τις εγκαταστάσεις και το προσωπικό του τα ακόλουθα σχολεία:

• Μαυρογένειο ΕΠΑΛ Σάμου
• Εσπερινό ΕΠΑΛ Σάμου
• Δ.Ι.Ε.Κ. Σάμου
• Σχολείο Δεύτερης Ευκαιρίας Σάμου

ενώ επίσης διαθέτουμε τον εξοπλισμό μας για την άσκηση τμημάτων του Πυθαγόρειου ΓΕΛ Σάμου και του Μεταλυκειακού έτους – Τάξης Μαθητείας, καθώς και για τη διεξαγωγή σεμιναρίων για την επιμόρφωση των εκπαιδευτικών στις ΤΠΕ. Συνολικά εξυπηρετούμε περί τους 456 μαθητές σε τρεις βάρδιες (πρωινή, απογευματινή, βραδινή). Το εκπαιδευτικό προσωπικό του Εργαστηριακού Κέντρου ανέρχεται στους τριάντα οκτώ (38) καθηγητές όλων των ειδικοτήτων.